TGIF:一些星期五爵士乐,由海洋微生物提供

为您带来一些令人敬畏的海洋,这是星期五的声音–不,没有撞击波浪或尖锐的海鸥(脊椎动物的嘘声)。这些声音来自微生物! Peter Larsen和Argonne国家实验室的同事(Gargantuan的家园 地球微生物组项目)将巨大的DNA序列数据集转变为音乐。聆听下面的爵士采样(视频),并向下滚动每个音乐主题的Science-Y解释。

每个旋律的描述 来自argonne实验室网站:

Elle的蓝调:该组成突出了L4站的海洋物理参数中的季节性模式。这些和弦是从光合作用辐射的季节性变化产生的。每种措施的旋律由8个音符组成,每个音符组成,每个测量值映射到物理环境参数,按以下顺序:温度,可溶性反应性磷酸盐,硝酸盐,亚硝酸盐,盐水,硅酸盐和叶绿素浓度。

盛开 :一些海洋微生物分类群在L4站社区中最常见的是非常低的丰富,但偶尔会成为高度优势的社区成员。为了将这些微生物绽放到相关的物理参数,该组合物中的和弦源自叶绿素浓度和盐度的变化。每种措施的旋律源自常见的稀有分类群的相对丰富,观察到偶尔以下列顺序绽放到更高的丰富:蓝藻,血管菌,血管素,假单胞菌,流发芽孢杆菌,芽孢杆菌和鞘氨醛植物。

远和宽:秩序的微生物物种Rickettiales,如高度丰富,自由活的浮游物种骨质骨质骨质骨质骨质骨质骨质骨质术,通常是L4站数据中的高度丰富的分类群。它在L4站的微生物群落中的相对丰度遵循独特的季节性模式。在该组合物中,每次测量有两种弦,从光合主动辐射测量和温度产生。每种措施的旋律是六个注释,描述了订单Rickettiales的相对丰富。每个测量的第一个音符是在时间点的相对丰度。措施的接下来的五个音符遵循以下模式之一:间距连续上升,间距连续下降,然后上升,节省下降,然后在间距上升。这些模式与给定时间点的Rickettsial的相对丰度匹配,相对于先前和后续的时间点。测量中的音符模式映射到每次措施较少的Rickettses的相对丰度,表明较高的丰度。对于Rickettiales是最丰富的微生物分类群的时间点,相应的措施被钹崩溃突出显示。

北方五十岁,西方四度:该组合物中的所有数据都源于2007年在L4站以每月间隔收集的12个观察时间点。该组合物由七种合唱组成。每个合唱都具有12个措施的相同的和弦进展,每个措施中的哪些措施源自温度和叶绿素的每月测量浓度。第一个和最后一个合唱的旋律是环境参数数据,如'Elle的蓝调'。第二个至第六合唱中的每一个中的旋律是由五个最常见的微生物分类:Rickettiales,乳菌,黄杆菌,蓝藻和假组织的相对丰富产生的。不同的“仪器”用于代表每个微生物分类。将微生物分类群的旋律作为“远和宽”产生。

霍莉巴克 (160个帖子)

我是加利福尼亚大学河畔的计算生物学家。我的研究使用DNA测序和基因组学研究海洋生态系统中的微生物真核生物(YEAH,NEMATODES!),重点是深海的进化和生物多样性。我既不能确认也不能否认我喜欢Unix,而不是我喜欢上海。


One Reply to “TGIF:一些星期五爵士乐,由海洋微生物提供”

  1. 嘿,我’m脊椎动物,我’在我的时间里做了一些音乐。 ;)

Comments are closed.